Alphas sigue a un equipo de ciudadanos comunes y corrientes cuyo cerebro sufren anomalías que les dan extraordinarias capacidades físicas y mentales. Tomando la justicia por sus propias manos, el equipo, dirigido por el Dr. Lee Rosen (David Strathairn) investiga los casos que sugieren la actividad de otros alphas, y descubrir lo que la CIA, el FBI y el Pentágono no han podido o querido resolver. Estos individuos talentosos deben equilibrar sus personalidades extravagantes y orígenes dispares con sus poderes no siempre visibles a medida que trabajan para resolver crímenes, detener bombas de tiempo y atrapar al enemigo.

La Unidad de Respuesta Estratégica es un grupo que forma parte de la élite policial. Ellos se encargan de resolver aquellas situaciones extremas de las que la policía no puede hacerse cargo. Rescate de rehenes, amenazas de bombas y criminales altamente armados serán sus principales objetivos...

Cada episodio se centra en un desastre aéreo, primero dando al público la sensación de estar en el avión y luego explicando por qué se produjo el accidente. La serie brinda a los tele-espectadores tanto la sensación visceral del desastre como la explicación racional de lo que sucedió y qué derivó la industria de la aviación como aprendizaje a raíz del accidente.