"Fauda" (en árabe "Caos") representa la historia de dos lados del conflicto israelí-palestino. Doron, un comandante de la unidad secreta israelí que opera dentro de los territorios palestinos, y su equipo, están persiguiendo al activista de Hamas, Abu-Ahmed. Al otro lado de la valla, la vida trágica de Abu-Ahmed y su familia, y las razones de su creciente odio hacia Israel.

Una agente de la CIA desconfiada, investiga a un hombre carismático que causa agitación política con un movimiento espiritual.

Un grupo de chicos marginados de la sociedad israelí se convierten en los principales sospechosos de la violación de una menor. A partir de ese momento, su ya desequilibrado mundo se tambalea por completo. Naomi, su profesora favorita y esposa de Avner, el comisario de la comisaría que está investigando el caso, se debate entre su marido y sus alumnos.