Un alienígena que busca justicia persigue a un criminal hasta un planeta llamado Tierra. Para expiar sus pecados decide ceder su poder a un humano que se convierte en un héroe llamado a proteger su mundo. Así es como nace "The Ultra Man", una reimaginación del famoso superhéroe japonés omnipresente en la TV de la década de los años 60.

Varios sucesos extraños están ocurriendo en todo el mundo, incluyendo la desaparición de dos ingenieros. El exalmirante Kosumi casi es secuestrado junto con su secretaria y ahijada, Makoto. El fotógrafo Susumu Hatanaka y su asistente han logrado frustrar el intento de secuestro. Más tarde se revela quiénes son los responsables de los misteriosos acontecimientos: es el Imperio Mu, teóricamente desaparecido hace 12.000 años, y están planeando invadir el mundo de la superficie para reclamar sus supuestas colonias. Es que la civilización del continente perdido ha sobrevivido a su catastrófico hundimiento, viviendo por miles de años bajo el océano Pacífico en cuevas inmensas.

Gorath es un meteoro errante (6000 veces más grande que nuestro planeta) que viaja inexorablemente en curso de colisión contra la Tierra, absorbiendo todo lo que se le envía. Los cientificos tendrán que evitarlo, pero la cosa es difícil ya que la solución propuesta para escapar niega todas las posibilidades de la física al apartar nuestro planeta del camino de Gorath. Tras una cumbre de científicos internacional se propone el lanzamiento de unos proyectiles desde el Polo Sur. Pero el calor provoca el derretimiento de un casquete y la liberación de Maguma, una monstruosa morsa gigante.

Mientras investigaba lo que aparentemente eran dos bolas brillantes que se perseguían una a otra, el oficial patrullero científico Hayata resulta muerto cuando uno de los ovnis choca accidentalmente con el Mini-VTOL que pilotaba. El ser que maneja el ovni, un gigantesco alien rojo y plateado procedente de la Tierra de la Luz en la galaxia Nebula M78, se siente responsable de la muerte. En compensación, decide entregar su fuerza vital al terrícola, devolviéndole así la vida. Al mismo tiempo le entrega un artilugio, llamado la Cápsula Beta, la cual, cuando es necesario, transforma en secreto a Hayata en un gigante alienígena que será conocido como Ultraman.