Serie anime basada en la saga de videojuegos Mega Man Battle Network. La serie se enfoca en Lan Hikari y su compañero Net Navi, MegaMan. Ellos van construyendo a lo largo de la serie una sólida amistad, mientras defienden la Net de diversas organizaciones criminales. Pero Lan y MegaMan no están solos, cuentan con la ayuda de Maylu Sakurai, Dex Ogregon, Yai Ayano y Tory Froid, así como sus respectivos Net Navis: Roll, GutsMan, Glide e IceMan. MegaMan NT Warrior se divide en cinco grandes temporadas: Exe, Axess, Stream, Beast y Beast+.

Tiene lugar en el año 1937, en vísperas de la Segunda Guerra Mundial, la historia trata de una organización de espionaje misteriosa conocida como la "Agencia D". La organización se establece por el Teniente Coronel Yuuki del Ejército Imperial Japonés. Sus ideales lo llevan a reclutar gente graduada de la academia militar, mientras que la formación para que se conviertan en agentes expertos en las artes de la manipulación. Estos agentes se convertirían en un equipo especializado para llevar a cabo las operaciones. Uno de estos agentes anti-héroe, bajo el nombre Jirou Gamou, va en una angustiosa misión para descubrir documentos secretos titulado "Notas negras", mientras luchan contra las fuerzas de dentro y fuera de sus propias filas.

La tripulación de la nave Bebop solo intenta ganar dinero, y son la pandilla de caza-recompensas más divertida del año 2071.

Todo comienza cuando un estudiante de bachillerato, Kazuki Muto (?????, Mut? Kazuki?) es asesinado al intentar salvar a una misteriosa chica que vestía un uniforme extraño, de un monstruo gigante. Aunque al despertar piensa que todo fue un sueño, pronto descubre que todo era cierto y que aquella chica lo revivió utilizando como reemplazo de su corazón un artefacto con poderes alquimicos llamada Kakugane. A partir de este momento Kazuki se involucra en el mundo de la alquimia y deberá decidir entre dejar ese recuerdo en el pasado o dedicar su vida a pelear contra las bestias devora-humanos llamadas homúnculos.

Falta el Dr. Oki, el genio científico que diseñó un nuevo tipo de submarino. Su hijo, Susumu, huele un plan malvado de un grupo desconocido. Él sabe todo sobre el submarino de su padre llamado "Super 99": equipo, armas, funciones y capacidad. Susumu piensa que encontrar a su padre es revelar la organización secreta, Helmet Party, y detener su conspiración. Con la ayuda de sus amigos y el Cuerpo de Marines, se embarca en una búsqueda submarina, sin saber lo peligroso que es su esfuerzo...

Cada temporada de Kamen Rider presenta una historia diferente con personajes y tramas independientes, aunque todas siguen un esquema similar. El protagonista suele ser un motorista que por diversos medios, la mayor de las veces tecnológicos y a veces mágicos o combinación de ambos según la temporada, se transforma, siempre utilizando la frase Henshin ("transformación") en un superhéroe llamado Kamen Rider con un traje blindado y una máscara que generalmente está decorada recordando a un insecto.En unas temporadas hay un solo Kamen Rider, mientras que en otras hay dos o más, habiendo algunas que presentan más de diez Riders diferentes. Estos Riders luchan contra enemigos diversos o incluso a veces entre ellos. Los poderes del Kamen Rider siempre tienen un origen estrechamente relacionado con los villanos, pero usa esos poderes para el bien en lugar de para el mal, y esta relación se convierte en fuente de conflictos argumentales según la temporada.

La historia gira alrededor de Allen Walker, un exorcista, al final imaginario del siglo XIX en Europa. Allen es un miembro de la orden religiosa oscura, formado por exorcistas, conectados con el Vaticano. La misión de la Orden es detener al Conde del Milenio, espíritu necrófago maligno que se propone limpiar el mundo destruyendo a todos los seres humanos con sus armas llamadas "Akuma"

Takamiya Honoka es un estudiante regular cuyo único problema parece ser que se sienta junto a Kagari Ayaka, # 1 de la belleza de la escuela. Ellos nunca han hablado el uno al otro antes y cualquier pequeña interacción entre los mismos resultados de forma inmediata en su club de fans de golpearlo. Sin embargo, cuando una parte que cae del edificio de la escuela está a punto de mandarlo a la otra vida, es Kagari que viene a su rescate. Sólo ... está vestida como una bruja, lo que lleva en sus brazos y flotando en una escoba ?! Kagari le dice que es su misión de proteger a él y que ahora por fin lo puede proteger abiertamente en lugar de encubierto.

Momosuke es un joven con un sueño: viajar por Japón y recopilar cien historias. Viaja de un lugar a otro, buscando historias de lo paranormal y extraño, con la esperanza de recopilar historias para publicarlas en su libro. Sin embargo, la calma de la vida de Momosuke pronto se ve rota por un encuentro casual con tres seres siniestros: el sacerdote Mataichi, el llamador de pájaros Nagamimi y la hermosa Ogin. Pronto, Momosuke descubre que sus nuevos camaradas podrían tener más cosas de las que parece a simple vista...

En el planeta mecánico de Cybertron viven superorganismos robóticos conocidos como Transformers. Allí entran en conflicto el ejército de convoyes de Transformers con sus viejos enemigos, los Destron, para hacerse con una nueva fuente de poder; una nueva raza de Transformers conocidos como Microns. Pero de duelo por la batalla, los Microns se van a la otra punta del universo. Cuatro millones de años después, en la Tierra, tres jóvenes activan un misterioso panel que se halla dentro de una cueva, que resulta ser un Micron dormido...

Tres facciones, Garan, Kiba y Hachiryokaku (u Octágono) compiten por el control total de la "isla de las máquinas" (posiblemente la isla de Bardos común en otras series de Mazinger) y la gran cantidad de recursos para la construcción de robots gigantes para sus respectivos ejércitos. La WSO ha podido saber que la cortina gravitatoria que mantiene en cuarentena la isla e incomunicada con el resto del mundo ha llegado a un estado inestable y explotará en 66 horas destruyendo la Tierra y todo lo que habite en ella. Conociendo el riesgo para desactivar el campo gravitatorio y el consiguiente enfrentamiento con sus facciones que controlan el mecanismo que lo genera, la WSO decide enviar a la Skull Force, formado por los escuadrones Crimson Falcon y Death Caprice, siendo este último compuesto únicamente de dos miembros, Ken Kaido y Ryo Magami, los pilotos del Mazinkaiser SKL.

En un futuro no muy lejano, el mundo se encuentra totalmente computerizado. Seres humanos con interfaces y cerebros artificiales se funden con máquinas alcanzando un nuevo nivel de existencia entre el mundo físico y la red digital. Para combatir los crímenes relacionados con las nuevas tecnologías ha sido creada una fuerza de choque antiterrorista con individuos 'mejorados' capaces de perseguir toda clase de criminales tanto en el mundo real como en el virtual. La Teniente cyborg Motoko Kusanagi y sus compañeros de la Sección 9 deben resolver una delicada crisis de rehenes, detener un tanque de asalto de última generación fuera de control y determinar la causa de los misteriosos suicidios de una serie de robots obsoletos. Todo ello antes de afrontar el desafío sin precedentes del esquivo pirata informático conocido como el 'Hombre que ríe'.