La Academia de Magos gira en torno a Takuto Hasegawa, quien asiste a una academia de magia que no está marcada en ningún mapa. Durante un examen de hechizo de invocación, accidentalmente crea una niña llamada Tanarotte, que tiene suficiente poder mágico para destruir su país, pero afortunadamente Tanarotte profesa lealtad (y amor) inquebrantable a su "creador".

Un chico corriendo al lado del tren... dos amigos de la infancia, una triste despedida. Así comienza la historia de Amaumi Haruhiko un estudiante que va a la academia Shimano en la ciudad del eterno arcoiris, Narasakicho... Una ciudad donde ocurren dos misteriosos fenómenos, Uno es el arco iris sobre la ciudad que nunca desaparece, el otro es un fenómeno mágico llamado gift, un regalo que se puede dar solo una vez entre dos personas que se aman, si es reciproco puede convertirse en algo muy especial.

Trata sobre Kōta Oyamada, un joven estudiante de primero de secundaria superior que se transfiere a la academia Kunpō. En su primer día de clases, una simpática estudiante de segundo año llamada Chizuru Minamoto le pide que vaya en su encuentro, solo, en la sala de música para conocerse. Cuando él llega, ella le confiesa que está enamorada de él y accidentalmente le revela que ella es en realidad una kitsune. Desde ese día los dos van juntos a la academia, y Chizuru se cuelga constantemente en Kōta algo que lo desconcierta grandemente debido a que otros lo miran despectivamente. Poco después de que la historia comience, una deidad lobo llamada Nozomu Ezomori se transfiere a la escuela y clase de Kōta. A partir de ese día, su vida se verá interrumpida por estas dos deidades, quienes competirán para decidir quien le corresponde a Kōta.

La trama se centra en un grupo de chicas que trabajan de “recargar” eléctricamente a la gente deprimida. En el universo de Fight Ippatsu! Juden-chan!! hay diferentes niveles de depresión, siendo el Nivel A el más peligroso porque implica riesgo de suicidio.

Takumi Nishijou, un estudiante de secundaria en la Academia Privada de Suimei, un día se entera de los asesinatos de 'New Gen' que han estado ocurriendo en la ciudad. A pesar de descartar el tema porque no lo involucra, Takumi comienza a experimentar extraños percances a su alrededor, desde una imagen horrible que recibió mientras estaba en su PC, hasta una misteriosa chica de pelo rosa parada en una escena de asesinato. A partir de ahí, Takumi lucha para hacer frente a los acontecimientos que se desarrollan a su alrededor, y pronto no se da cuenta de lo que es real o de un engaño. A medida que su destino se abre ante él, el autor de los eventos de la 'New Gen' intenta encontrarlo, llevándolo a un mundo donde nada es lo que parece.

El protagonista de la historia, Jun'Ichi Asakura, que va a la Academia Kazami, tiene el poder de ver los sueños de los demás cuando duerme. Además, aprendió la magia que le enseñó su abuela, que le permite crear dulces. Un día, Jun'Ichi parece haber visto los sueños de otra persona cuando dormía. En ese sueño, una niña de su propia infancia apareció. Pero su hermana Nemu lo despierta, haciéndolo volver de golpe a la realidad. Aunque no son realmente hermanos (ella es adoptada) tienen una vínculo muy fuerte, tanto que a veces da la impresión de que fueran amantes.

El protagonista de la historia, Jun'Ichi Asakura, que va a la Academia Kazami, tiene el poder de ver los sueños de los demás cuando duerme. Además, aprendió la magia que le enseñó su abuela, que le permite crear dulces. Un día, Jun'Ichi parece haber visto los sueños de otra persona cuando dormía. En ese sueño, una niña de su propia infancia apareció. Pero su hermana Nemu lo despierta, haciéndolo volver de golpe a la realidad. Aunque no son realmente hermanos (ella es adoptada) tienen una vínculo muy fuerte, tanto que a veces da la impresión de que fueran amantes.

Mago de la oscuridad. Un término dado a los que tienen la misión de proteger al mundo contra la oscuridad inminente. Renji Hiiragi es un mago de la oscuridad, que es llamado constantemente a misiones, aun cuando todo lo que desea es ir a la universidad y graduarse. Sin embargo, su ultima orden fue proteger a Elis Shiho, que es una nueva estudiante transferida a su academia. Siendo inducido al club de astronomía por su amiga de infancia Renji, Kureha Akabane en su primer día en la escuela, Elis se da cuenta que ella también, tiene el poder de convertirse en una maga de la oscuridad, después de poseer una de siete joyas secretas, la joya de la amabilidad. Junto con Renji y Kureha, Elis ahora comienza su lucha y su nueva vida, como mago de la oscuridad.

Los dos clanes mas fuertes del japón deciden unir su sangre para concebir al peleador mas fuerte del mundo. Kuzuryu Momoko, la primogénita de una de estas familias decide tener un hijo a toda costa con Inuzuka Kouji, miembro del otro clan que la evita e ignora pensado que esta loca, esto dará pie a muchas ocurrencias por parte de nuestros protagonista

Nagisa Aoi es una estudiante de primer año de preparatoria que decide ir a la Colina Astraea después de que sus padres fueran transferidos al extranjero. Este lugar acoge a chicas de tres escuelas exclusivas para señoritas: Saint Mitre, Saint Spica y Saint Le Rime. Tras conocer a su compañera de habitación, Tamao Suzumi, y hacerse amiga de diversas chicas, pensaba que su vida escolar sería ordinaria. Sin embargo, conoce a la representante de las tres escuelas, Shizuma Hanazano, también conocida como Étoile, quien es querida por todas las estudiantes. Ambas tienen un peculiar primer encuentro, y Shizuma parece sentir una simpatía inusual por Nagisa. Jamás imaginó que unos simples lazos de amistad podrían transformarse en algo más profundo.

Karin Hanazono es huérfana y vive con sus familiares. Su vida nunca ha sido fácil, sus estudios no van bien, no es la mejor en los deportes y técnicamente es miserable. Al quedarse solo con un anillo como recuerdo de su difunta madre, de repente descubre que su vida ha cambiado, mientras estaba de luto por su gato, Shii-chan. Esa noche conoció a un chico extraño, Kazune Kujyou. Después de ese evento, ella experimenta varias incidencias misteriosas que pronto la llevaron a descubrir que es una pequeña diosa. Al encontrar a otros como ella, pronto se propone comprenderse mejor a sí misma a medida que sus misteriosos poderes crecen y se ve acosada por oponentes.