Comedia de animación que narra el día a día de un grupo de niños, sus aventuras y sus esfuerzos para encajar... con la particularidad de que esos niños son, en realidad, amebas. Éstas viven en una laguna, con un barrio residencial normal y sus correspondientes calles ordenadas y escuelas, pero la laguna solo está habitada por organismos unicelulares. Este mundo submarino no se libra de los prejuicios ni de los grupos sociales y, por ello, las algas son los niños populares, los parásitos no son de fiar y las bacterias destacan por ser bastante desordenadas.

La señorita Frizzle y su alumnos viajan en un autobús mágico para vivir sorprendentes aventuras y aprender sobre la ciencia.