La historia se divide en dos partes. Por un lado tenemos a Ryouma Sengoku y su pasado, su obsesión, su relación con Takatora Kureshima, y la creación de los Sengoku Drivers y los Genesis Drivers. En el medio una extraña amenaza llega a la ciudad utilizando su propia creación siendo alguien de su pasado quien le hará frente.Por otro lado la batalla entre Kouta y Kaito a finalizado, y todos deciden seguir con sus vidas. Zack emprende su viaje a Nueva York para volverse un bailarín profesional, pero un llamado cambiará su destino ya que alguien está usurpando el nombre del Equipo Baron. *Ubicada en el medio de la serie, y al final, sin un lugar específico.

¿Qué hacían ciertos personajes mientras la historia principal se llevaba a cabo? Por un lado tenemos a Takatora Kureshima, quien recibe la noticia de que su padre ha fallecido, de parte de una vieja amiga de la infancia. En ese mismo momento alguien desconocido ataca Yggdrasill, lo cual llevará a Takatora a investigar sobre el pasado de su padre, descubriendo una cruda verdad que nunca se hubiese imaginado. Por el otro lado Kaito Baron se verá metido en una situación compleja cuando un chico de otro país lo secuestra para hacerse pasar por él ya que ambos son idénticos. Sin saberlo el muchacho es buscado parar ser asesinado, y aquí será donde conoceremos el cruel pasado que envuelve a Kaito llevándolo a ser lo que es en la actualidad.

Un misterio comienza a ocurrir en Ciudad Zawame con un llamado mundo en el interior de la misma Tierra. Kouta y Mai deciden investigar la situación y es allí donde se encuentran con un chico que posee la habilidad de dar vuelta todo lo que toca. Éste les dice que tiene que hacer algo sí o sí, pero no recuerda qué. De la nada son sorprendidos por un Takeshi Hongou, el legendario primer Rider quien le dice a Kouta que no tiene el valor para ser un guerrero. Instantaneamente son atacados por unos monstruos y la historia comienza a desarrollarse con un nuevo imperio que aparece para acabar con los seres vivos utilizando el poder del muchacho y una dura historia de fondo. *No tiene relación con algún acontecimiento en la serie, por lo que puede verse en cualquier momento, o si prefieren recién después de que haga su aparición el Kachidoki Arms.

Los ToQgers llegan a una estación de tren cerca de la misteriosa Zawame City, cuyos ciudadanos son amables todo el tiempo y parece no haber actividad de los Sombra. Sin embargo, mientras exploran esta ciudad y se preparan para cenar, una amenaza surge en la forma de un monstruo extraño. Cuando los ToQgers tratan de hacer frente a este enemigo, se encuentran con un extraño hombre que se transforma en el Rider Blindado, Gaim. Estos 2 héroes deberán unir fuerza y derrotar al Imperio Badan, que tratará de acabar con la humanidad.

Haruto está en busca de un lugar para el anillo de Koyomi, mientras en la ciudad los Phantoms han regresado, pero uno en particular tiene la habilidad de ingerir el poder de otros de su clase para volverlos propios. Nitou deberá tomar la decisión de volver a llamar a Chimera dejando de lado la libertad que éste le había otorgado. Haruto pierde su anillo y ahora el pasado lo condenará y deberá seguir adelante sino las cosas no podrán afrontarse. Mientras tanto en otra dimensión, los Beat Riders están en un concurso de todos contra todos cuando un misterioso enemigo aparece de una crack. Kouta, Kaito y Micchy lo siguen sin saber que llegarán a un tiempo antiguo, pero no tanto a la vez con guerras por las tierras, y matanzas por doquier, donde un nuevo villano ha aparecido para tomar control de todo.

El parece vivir en paz tras la batalla que casi acaba con todo en Ciudad Zawame, pero en su nuevo mundo Mai y Kouta son atacados por una nueva amenaza la cual logra lo que parecía imposible: derrotar a un Dios. De allí un nuevo mal invadirá la Tierra y serán los guerreros Riders quienes deberán enfrentarse a fantasmas del pasado. Mientras tanto, y sin saber nada de esto, Tomari Shinnosuke se encuentra investigando los misteriosos robos del ladrón conocido como Lupin el cual le traerá más un dolor de cabeza. Las fuerzas de dos de los grandes Riders de los últimos años se unirán para dar una gran batalla. *Estrenada luego del episodio 9 de la serie.

Los Lock Seeds de Kouta y Kaito misteriosamente se oxidan y dejan de funcionar. En ese momento la misteriosa chica de igual imagen que Mai aparece frente a ellos para decirles que tendrán que pasar por 4 pruebas para que éstos artefactos vuelvan a poder utilizarse. Desde limpiar, hasta aprender a cocinar serán algunas de las tareas que tendrán Kouta, Kaito y Mai para regresar todo a la normalidad.

Kouta sigue su lucha contra la invasión de Helheim y los Invess en una ciudad en cuarentena, cuando un misterioso muchacho aparece ante él preguntándole que era el fútbol y al enterarse que era una batalla donde nadie terminaba muerto desaparece inmediatamente. Desconcertado, Kouta escucha personas gritando de alegría y aparece en un estadio de fútbol donde el equipo Gaim y Baron jugarán un partido por la Copa el Fruto Dorado. Todo es tranquilidad, y al mismo tiempo muy extraño, y es solamente Kouta quien nota las diferencias.De la nada Peko y Hase se vuelven locos de poder y ante una lucha que desencadenan desaparecen misteriosamente quedando solamente sus Lock Seeds. Micchy descubre que algo anda mal, y que éste ya no es su mundo por lo que comenzará la investigación para saber dónde se encuentran ahora.

1º Parte: Kamen Rider Gaim - Charla con el Elenco: Introducción y Entrevista Evento realizado por todo Japón bajo el título de "Escenario Final" donde además de brindar un show, los miembros más importantes del elenco hablan de la serie una vez esta finalizada, con sus experiencias durante el rodaje de la misma. 2º Parte: Aquí los guerreros fallecidos volverán a la vida gracias al poder de un misterioso ser llamado Maja quien planea conquistar el mundo. Kouta intenta hacerles frente pero sus fuerzas no son suficientes y cae en un terrible percance. Es por ello que se necesita del poder de viejos conocidos para volver todo a la normalidad.