La historia se divide en dos partes. Por un lado tenemos a Ryouma Sengoku y su pasado, su obsesión, su relación con Takatora Kureshima, y la creación de los Sengoku Drivers y los Genesis Drivers. En el medio una extraña amenaza llega a la ciudad utilizando su propia creación siendo alguien de su pasado quien le hará frente.Por otro lado la batalla entre Kouta y Kaito a finalizado, y todos deciden seguir con sus vidas. Zack emprende su viaje a Nueva York para volverse un bailarín profesional, pero un llamado cambiará su destino ya que alguien está usurpando el nombre del Equipo Baron. *Ubicada en el medio de la serie, y al final, sin un lugar específico.

El parece vivir en paz tras la batalla que casi acaba con todo en Ciudad Zawame, pero en su nuevo mundo Mai y Kouta son atacados por una nueva amenaza la cual logra lo que parecía imposible: derrotar a un Dios. De allí un nuevo mal invadirá la Tierra y serán los guerreros Riders quienes deberán enfrentarse a fantasmas del pasado. Mientras tanto, y sin saber nada de esto, Tomari Shinnosuke se encuentra investigando los misteriosos robos del ladrón conocido como Lupin el cual le traerá más un dolor de cabeza. Las fuerzas de dos de los grandes Riders de los últimos años se unirán para dar una gran batalla. *Estrenada luego del episodio 9 de la serie.

Kouta sigue su lucha contra la invasión de Helheim y los Invess en una ciudad en cuarentena, cuando un misterioso muchacho aparece ante él preguntándole que era el fútbol y al enterarse que era una batalla donde nadie terminaba muerto desaparece inmediatamente. Desconcertado, Kouta escucha personas gritando de alegría y aparece en un estadio de fútbol donde el equipo Gaim y Baron jugarán un partido por la Copa el Fruto Dorado. Todo es tranquilidad, y al mismo tiempo muy extraño, y es solamente Kouta quien nota las diferencias.De la nada Peko y Hase se vuelven locos de poder y ante una lucha que desencadenan desaparecen misteriosamente quedando solamente sus Lock Seeds. Micchy descubre que algo anda mal, y que éste ya no es su mundo por lo que comenzará la investigación para saber dónde se encuentran ahora.

¿Qué hacían ciertos personajes mientras la historia principal se llevaba a cabo? Por un lado tenemos a Takatora Kureshima, quien recibe la noticia de que su padre ha fallecido, de parte de una vieja amiga de la infancia. En ese mismo momento alguien desconocido ataca Yggdrasill, lo cual llevará a Takatora a investigar sobre el pasado de su padre, descubriendo una cruda verdad que nunca se hubiese imaginado. Por el otro lado Kaito Baron se verá metido en una situación compleja cuando un chico de otro país lo secuestra para hacerse pasar por él ya que ambos son idénticos. Sin saberlo el muchacho es buscado parar ser asesinado, y aquí será donde conoceremos el cruel pasado que envuelve a Kaito llevándolo a ser lo que es en la actualidad.

1º Parte: Kamen Rider Gaim - Charla con el Elenco: Introducción y Entrevista Evento realizado por todo Japón bajo el título de "Escenario Final" donde además de brindar un show, los miembros más importantes del elenco hablan de la serie una vez esta finalizada, con sus experiencias durante el rodaje de la misma. 2º Parte: Aquí los guerreros fallecidos volverán a la vida gracias al poder de un misterioso ser llamado Maja quien planea conquistar el mundo. Kouta intenta hacerles frente pero sus fuerzas no son suficientes y cae en un terrible percance. Es por ello que se necesita del poder de viejos conocidos para volver todo a la normalidad.