Dos aviones de pasajeros colisionan poco antes de tomar tierra en el aeropuerto de Minneapolis. Pero antes del choque se produce una explosión, y uno de los copilotos descubre que antes de esa explosión todos los pasajeros ya estaban muertos.

Cuando una catástrofe natural amenaza con destruir el sagrado Árbol de las Almas, Ralu y Entu, dos niños Omaticaya al borde de la edad adulta, deciden sin miedo tomar el asunto en sus propias manos. Al enterarse de que Toruk puede ayudarlos a salvar el Árbol de las Almas, emprenden, junto con su nuevo amigo Tsyal, una búsqueda en lo alto de las Montañas Flotantes para encontrar al poderoso depredador rojo y naranja que gobierna el cielo de Pandora. La profecía se cumple cuando un alma pura se levanta entre los clanes para montar en Toruk por primera vez y salvar a los Na'vi de un destino terrible.