La Isla Academia es una escuela de élite a la que asisten varios estudiantes genios de todo el mundo. Entre ellos están Yusuke Amamiya, Jō Ohara y Megumi Misaki, quienes junto a Takuji Yano y Mari Aikawa buscan crear un traje lo suficientemente fuerte como para servir para la exploración espacial. Sin embargo, tres compañeros de clase y buenos amigos hasta entonces, Kenji Tsukigata, Rui Senda y Gō Omura, pensaron que sus talentos se estaban desperdiciando y decidieron marcharse para unirse a una organización maligna llamada Volt liderada por el Gran Profesor Bias, antiguo doctor en Ciencias y Biología, que les ofreció maximizar todo su potencial científico...

Hace 400 años, los ninjas y los Yōkai tuvieron una gran guerra. El legendario Sarutobi Sasuke y otros cuatro ninjas sellaron al comandante Nurarihyon de los Yōkai y todas sus energías diabólicas en una cueva protegida por la "Puerta del Sello". En el presente, uno de los pocos Yōkai que quedan, Kappa, engaña a los descendientes de Sarutobi y Kirigakure Saizō, Saizō y Sasuke, para que liberen a Yōkai abriendo la puerta. Ellos dos ahora, junto a otros tres descendentes de grandes ninjas, se convierten en los Kakuranger para luchar contra los renacidos Yōkai.