La serie se centra en dos agentes federales enviados al misterioso Almacén 13, en Dakota del Sur, donde el gobierno guarda, bajo el más absoluto secreto, todo tipo de artefactos extraños.

"La Tierra: conflicto final" nos sitúa en pleno siglo XXI, tres años después del primer contacto con una raza extraterrestre, los Taelons. Su llegada ha supuesto para la Tierra un gran avance, el fin del hambre, las guerras y de muchas enfermedades. Los Taelons parecen desear únicamente compartir sus conocimientos y enriquecerse con su convivencia en paz con la raza humana. Desean ser compañeros que ayuden a la humanidad a dar un importante paso. Consideran que la Tierra se encuentra en una encrucijada evolutiva y que para la especie humana ha llegado un momento crucial en el que deben dar el siguiente paso hacia fronteras inciertas. Sin embargo hay gente que no confía en los Taelons, también conocidos como compañeros, y, secretamente, conspira para descubrir cuales son sus verdaderos propósitos.

Un grupo de humanos mutantes tienen como misión buscar y proteger a los supermutantes. En su momento, los supermutantes fueron creados por el gobierno pero su existencia corre peligro a manos de los mismos científicos gubernamentales que los crearon. Uno de los científicos responsables de los supermutantes, Adam, ha jurado ayudarles e intentar interceder por ellos. Sin embargo, su compañero de proyecto, Mason Eckhart, planea usarlo para su propio beneficio. Adam reúne a cuatro mutantes y crea con ellos el grupo "Mutant X" para ayudar a los supermutantes de todo el mundo e interponerse a los malvados planes de Eckhart.

Nos encontramos con Sarah, una joven huérfana sin ningún sitio donde caerse muerta que es testigo del suicidio de una chica que es idéntica a ella. Sarah decidirá asumir su identidad, cuenta bancaría, hogar y demás solo para encontrarse en medio de una tremenda conspiración con clones de por medio.

Sydney Fox es una profesora y 'cazadora de reliquias' trotamundos que busca artefactos antiguos para devolverlos a los museos y/o a los descendientes del propietario original. La ayuda su asistente lingüístico Nigel y, ocasionalmente, su secretaria un poco tonta, Claudia. A menudo termina luchando contra cazadores rivales que buscan artefactos por dinero.

Ambientada en una pequeña ciudad de Michigan donde la única industria que queda son las cárceles federales, estatales y privadas, la historia sigue a la familia McClusky, los intermediarios del poder entre la policía, los delincuentes, los presos, los guardias de prisiones y los políticos, en una ciudad completamente dependiente de las prisiones. y los prisioneros que contienen.