Cada 5.000 años se abre una puerta entre las dimensiones. En una dimensión existe el Universo y la vida. En la otra dimensión existe un elemento que no está hecho ni de tierra, ni de fuego, ni de aire, ni de agua, sino que es una anti-energía, la anti-vida: es el quinto elemento.

Emily (Maggie Cheung), tras pasar seis meses en la cárcel por posesión de drogas, sólo tiene una obsesión: recuperar a su hijo, que está viviendo con sus suegros lejos de ella. Para lograrlo Emily tiene que reconstruir su vida... estar limpia.

Tras esquivar la muerte, Major Kusanagi resucita como cíborg y encabeza un equipo de caza de ciberterroristas. Pero un pirata informático se reserva otros planes.