2B es una unidad que participa en una misión que tristemente sale mal y eliminan a todo su equipo. Ella intenta seguir con su misión, donde conoce a 9S.

La historia sigue a Richard Ranashinha Dvorpian, un apuesto tasador británico de joyas y a Seigi Nakata, un estudiante universitario japonés brillante y recto. El dúo resuelve varios casos relacionados con joyas al desentrañar los aspectos psicológicos ocultos de sus dueños que se encuentran dentro de las gemas.

Yui es una chica que acaba de comenzar el instituto y cuya ilusión es unirse a algún club, aunque no sabe a cuál. Mio y Ritsu son dos amigas de la infancia que llegan juntas al instituto y deciden unirse al Club de Música Pop, o al menos es lo que Ritsu quiere y con ello arrastra a Mio en contra de su voluntad. El club ha perdido a todos sus miembros y solamente quedan ellas dos como nuevas, si no consiguen a dos miembros más en menos de 10 días les cerrarán el club. La fortuna hace que una chica que buscaba otro club acabe uniéndose a ellas y la cuarta en unirse al club será Yui. La cosa es que Yui no tiene ni idea de tocar instrumentos, al contrario que sus 3 compañeras, así que comenzará desde 0 y con mucha ilusión a tocar la guitarra para que juntas puedan tocar como Dios manda.

Manji es un espadachín inmortal, que ha sido maldecido con vida eterna. Se ha cansado de vivir con toda la muerte que ha creado. No tiene más habilidades que las de matar, por lo que forma un plan para recuperar su mortalidad: matará a cien hombres malvados por cada uno bueno que haya matado. La vieja bruja que afligió a Manji con la inmortalidad está de acuerdo con la propuesta de Manji y Manji se encuentra en su camino para matar a mil hombres malvados. En su viaje, conoce a una joven, Rin, que tiene su propia venganza para buscar contra la escuela de espadas cuyos miembros mataron a la familia de Rin. Rin y Manji viajan juntos, cada uno con la esperanza de encontrar algún tipo de paz. En su camino hay muchos enemigos variados. Rin y Manji están casi constantemente bajo ataque y deben aprender a vivir sus vidas, evitando ser consumidos por la venganza.