La historia gira en torno a Yuuri Katsuki, que llevaba todas las esperanzas de Japón sobre sus hombros para ganar la Gran Prix Final, una competición de patinaje sobre hielo, pero sufre una aplastante derrota. Al regresar a su hogar en Kyushu siente el deseo de retirarse, pero una parte de él quiere seguir en el patinaje sobre hielo. Con esos sentimientos encontrados arremolinándose dentro de él, él se confina dentro de la casa de su padres. De repente, el cinco veces consecutivas campeón mundial de pantinaje sobre hielo, Victor Nikiforov, aparece delante suyo, y junto con él está Yuri Plisetsky, una joven patinador ruso que está ganando fama. Victor y ambos Yuris aceptan el reto sin precedentes de Gran Prix.

Takayanagi es un misterioso profesor de secundaria que enseña ética. Sus estudiantes parecen inocentes, pero tienen serios problemas como ser acosados y lastimarse a sí mismos. Takayanagi lanza palabras e ideas sobre ética y filosofía a sus estudiantes. Las palabras escritas en el libro de texto de ética parecen aburridas, pero las palabras de figuras como Sócrates afectan a los estudiantes a lidiar con sus propios problemas y vidas.

Mientras el mundo se ve amenazado por la repentina aparición de una misteriosa nave nodriza alienígena, los mejores amigos Koyama Kadode y Nakagawa “Ontan” Oran continúan con su vida en la escuela secundaria. Pero a medida que crecen, enfrentan preguntas existenciales, aprenden las complejidades de la edad adulta y que la verdadera amenaza puede no venir de arriba.