En el período Edo, en la remota aldea de Okitsu, el malvado líder de una secta Koushirou usa ninjutsu para hechizar a los tiburones y los obliga a atacar a los buceadores de perlas locales para que la secta pueda robar las perlas de sus cadáveres destrozados. Desesperado por obtener ayuda, el jefe de la aldea contrata a Kotaro Shiozaki, un guardia en un templo cercano, pero Kotaro pronto encuentra su camino bloqueado por la dama ninja Kikuma y un tiburón gigantesco que no parece ser algo de este mundo.

Sakurai-san ha elegido sacrificar su vida para que Airi pudiera tener un futuro. Mientras tanto Yuuto, quien debería ser ese hombre del cual se enamorase la hermana de Ryoutarou no parece ser la persona ideal ya que no hay amor entre ellos. Ésto es algo que le preocupa a Deneb por lo que intentará un par de planes nada convencionales. En el medio el Den-Liner será un tren sin rumbo alguno por la aparición de un Imagin misterioso.

Una misteriosa raza de monstruos conocidos como Oni ha reaparecido en el presente. Según cuenta la leyenda, estos fueron derrotados hace cientos de años y por ello no se sabe el porqué de su reaparición. Están en busca de una poderosa piedra que le permitirán reunir a los dos máximos líderes de los Oni. Momotaros y compañía deberán evitar que los Oni encuentren esa piedra sino será el final de todos, pero necesitarán de la ayuda de alguien más para acabar con estos malos. *Ubicada al final de la serie

Ichigo y Nigo han eliminado a Shocker de una vez por todas al derrotar al Gran Líder de dicha organización. Pero cuando la victoria parecía consumada, un misterioso guerrero llamado Kamen Rider Sangou aparece frente a los dos héroes y los derrota provocando que todo lo conocido hasta el momento cambie. Una nueva realidad será creada donde el bien es el mal, y los villanos serán héroes. Deberá surgir la justicia y la identidad propia para poder restaurar todo a como estaba, aunque al final esto no sea suficiente. *Estrenada luego del episodio 22.

La batalla contra Shocker y su Máquina de Corrección de la Historia ha terminado, cobrándose la vida de Gou. Pero algo extraño sucede, ya que Tomari se encuentra junto a Yuto y Takumi enfrentándose nuevamente a Shocker como si nada hubiese ocurrido junto a un Mach vivo. Nadie recuerda nada, pero las cosas se vuelven más confusas cuando ante cada muerte el tiempo se reinicia comenzando todo otra vez desde el mismo punto. Las emociones de los Riders serán el punto central y para detener ésto deberá decirse adiós a uno de los guerreros que protegen el mundo. *Continuación directa de Super Hero Taisen GP - Kamen Rider Sangou

Ryoutarou y compañía han creado la Policía DenLiner con la cual resuelven los crímenes que han ocasionado los Imagins. Ahora una extraña investigación involucra a una llamada Organización del Mal, la cual está liderada por un Imagen quien manda por sobre otros de su misma especie además de los Fangire, una especie de monstruos que han comenzado a aparecer hace poco. Momotaros y los demás deberán descubrir detrás de qué está la organización y cuando todo marche mal necesitarán la ayuda de un nuevo héroe. *Ubicada luego del final de la serie

La historia tiene lugar después de los acontecimientos de la serie,Momotaros y Kohana salen de la DenLiner por un día a visitar a Ryotaro y Airi después de su despedida como consecuencia de su batalla con Kai. Sin embargo, ven un tren fantasma misterioso.

El DenLiner ha sido robado por unos imagins y su líder, Gaou, quien pretende encontrar la Linea de Dios para poder controlar el tiempo y para ello necesitará del Tren de Dios. Ryoutarou y Hana no llegan a abordar el DenLiner, y luego en la tienda de Airi se encuentran con un joven Roytarou. Cuando Momotaros escapa del tren secuestrado intenta poseer al Ryoutarou grande, pero termina poseyendo al pequeño. En ese momento Yuto aparece y les dice que es debido a que el joven ha perdido la memoria con respecto a Momotaros y compañía. Ahora todos deberán perseguir a Gaou para quitarle el DenLiner y derrotarlo antes de que cumpla con su malévolo plan. *Ubicada entre los episodios 27 y 28