En 1966, cinco niños son secuestrados por un grupo alienígena conocido como los Cazadores Alienígenas, que trabajan para el Imperio del Experimento Reconstructivo Mess, que buscaban muestras humanas para experimentar. Los niños son rescatados por los archienemigos de Mess, la raza alienígena Flash, que se llevó a cada uno a un planeta diferente del sistema solar Flash para entrenarse. Cada uno fue entrenado por separado en una variedad de superpoderes que les permitirían luchar contra Mess, y sus cuerpos asimismo se adaptaron a la atmósfera del sistema solar Flash, lo que les dio habilidades especiales. Cuando finalmente regresaron a la Tierra en 1986 para combatir a Mess, que ahora está intentando invadirla, aprovechan la oportunidad para buscar a sus parientes biológicos. Después descubren que su tiempo en la Tierra está limitado, ya que la atmósfera de la Tierra se ha convertido en venenosa para ellos, y en un año morirán por lo que se llama el fenómeno Anti-Flash.

La Isla Academia es una escuela de élite a la que asisten varios estudiantes genios de todo el mundo. Entre ellos están Yusuke Amamiya, Jō Ohara y Megumi Misaki, quienes junto a Takuji Yano y Mari Aikawa buscan crear un traje lo suficientemente fuerte como para servir para la exploración espacial. Sin embargo, tres compañeros de clase y buenos amigos hasta entonces, Kenji Tsukigata, Rui Senda y Gō Omura, pensaron que sus talentos se estaban desperdiciando y decidieron marcharse para unirse a una organización maligna llamada Volt liderada por el Gran Profesor Bias, antiguo doctor en Ciencias y Biología, que les ofreció maximizar todo su potencial científico...