Una joven estudiante de universidad, Yumi Nakamura (Kou Shibasaki), ve cómo sus amigos mueren uno a uno víctimas de una extraña “maldición” que parece tener su origen en el teléfono móvil. Todo empieza cuando Yoko, la mejor amiga de la protagonista, recibe una llamada a su móvil con un extraño tono que no había oído antes. En la pantalla aparece un mensaje: “Tienes una llamada perdida”. Cuando lo escucha, no sólo parece venir de su propio número, sino que también contiene un terrible grito que suena exactamente igual que la voz de Yoko. Además, la llamada está fechada tres días después. Tres días más tarde, Yoko muere. Las coincidencias empiezan a acumularse mientras se amplia el círculo de avisos de muerte a través de los móviles. Hasta que un día, el móvil de Yumi comienza a sonar...

En el amanecer de un nuevo milenio, el país está al borde del colapso. Millones de personas vagan sin empleo. La violencia en la escuela está descontrolada y adolescentes rebeldes protagonizan boicots masivos. El gobierno contrataca con “Battle Royale”. Cada año, una clase es escogida al azar para que se enfrente, en una isla abandonada, a un cruel juego de supervivencia.

En 1999, un enorme meteorito se estrelló contra la Tierra y causó una calamidad global que agotó las aguas del planeta. Además, el meteorito transportaba criaturas extraterrestres conocidas como los Gusanos que procedieron a matar humanos y asumir sus identidades. Para contrarrestar esta nueva amenaza, se formó ZECT, que a su vez creó el Sistema de Kamen Rider para combatir a los gusanos. Las batallas duran más de siete años, agotando los recursos de la Tierra y convirtiéndolo en un páramo árido. En la actualidad, las luchas de poder en ZECT han provocado que Hidenori Oda establezca un grupo disidente llamado Neo-ZECT con Daisuke Kazama y Shura Hokuto para luchar contra la autoridad de ZECT. Un misterioso joven llamado Souji Tendou llega a la ciudad y decide vender su poder a Neo-ZECT o ZECT para su propia agenda personal.